Protokół operacyjny, zgodnie z rozporządzeniem w sprawie dokumentacji medycznej, stanowi dokumentację indywidualną wewnętrzną, którą należy dołączyć do historii choroby. Obowiązujące przepisy nie określają, jakie konkretnie informacje powinien zawierać Protokół operacyjny. Praktyka pokazuje jednak, że im bardziej szczegółowe dane zostaną wskazane w protokole, tym lepiej.